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基因组选择已成为畜禽遗传评估的主流技术,大幅度提高畜禽遗传改良进展。为提高我国动物遗传育种专业研究生和青年教师数量遗传学理论和实践水平,强化基因组选择技术研究和推广应用,特举办本次培训班。邀请山东农业大学张勤教授、威斯康星大学麦迪逊分校Guilherme J. M. Rosa教授和美国美国奶牛育种委员会/威斯康辛大学动物和乳业科学系吴晓林教授进行授课。
时间:2024.8.12-16,上午8:30-11:30,下午14:30-17:30。8月11日下午报到。
开班之前,将于8月10日举办“动物育种前沿技术研讨会”,邀请Jack Dekkers、Guilherme J. M. Rosa、David Casey、张勤、吴晓林、丁向东、赵福平等专家做报告,欢迎学员参加本次研讨会。
地点:湖南农业大学。
培训费用:本次培训不收取培训费用,差旅费自理。
培训对象:各兄弟院校遗传育种专业青年教师和研究生。
报名及人员确认:本次培训采取自愿报名方式,为保证培训效果,暑期学校组委会将根据报名时提供的材料进行遴选,培训人数控制在50人以内。请有意向参加本次培训的青年教师和研究生在7月25日前将报名材料打包发送至HUNAU_summerschool@163.com,报名时请提供个人基本情况介绍(个人简介、R和数量遗传学实践基础、研究背景),研究生还需提供导师推荐信。
备注:本次培训含编程实操,请学员自带电脑并提前安装R和Rstudio软件。
联 系 人:何俊 hejun@hunau.edu.cn;高宁 gaon@hunau.edu.cn
支持单位:农业农村部畜禽资源(猪)评价利用重点实验室
优质畜禽产品生产省部共建协同创新中心
岳麓山实验室
畜禽遗传改良湖南省重点实验室
赞助单位:石家庄博瑞迪生物技术有限公司
主办单位:湖南农业大学动物科学技术学院
暑期学校课程内容:
Monday, August 12th, AM: Matrix algebra, Linear models, and BLUP —张勤
Monday, August 12th, PM: Matrix algebra, Linear models, and BLUP —张勤
Tuesday, August 13th, AM: Matrix algebra, Linear models, and BLUP—张勤
Tuesday, August 13th, PM: Genomic Selection using mixed models (GBLUP, ssGBLUP) —Rosa
Wednesday, August 14th, AM: R programming for genomic selection —吴晓林
Wednesday, August 14th, PM: Penalized regression (Ridge Regression, Lasso, Elastic Net) —Rosa
Thursday, August 15th, AM: Prime to Bayesian Analysis and MCMC —Rosa
Thursday, August 15th, PM: Genomic Selection using Bayesian Regression—Rosa
Friday, August 16th, AM: Machine learning methods (SVM, Decision Trees, Artificial Neural Network) —Rosa
Friday, August 16th, PM: R programming for genomic selection —吴晓林
授课教师:
张勤,男,山东农业大学教授,博士生导师,国家杰出青年基金获得者。曾任中国农业大学教授,中国畜牧兽医学会常务理事、动物遗传育种学分会理事长和信息技术分会理事长,农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室主任,国家动物遗传资源委员会猪专业委员会委员,全国生猪遗传改良计划专家组副组长。主要研究领域为动物统计遗传学和动物育种。作为第一或通讯作者发表论文200余篇,其中SCI收录论文100余篇,主编专著4部、教材3部,获国家科技进步二等奖2项(第1和第5完成人),北京市科学技术一等奖和二等奖各一项(第1和第2完成人),中华农业科技奖二等奖、教育部科技进步二等奖和广东省科技进步一等奖各一项(第3完成人)。
Guilherme J. M. Rosa is currently a professor of statistical genomics and livestock data analytics at the University of Wisconsin-Madison, USA. He teaches undergraduate courses in animal breeding and genetics, and grad level courses in Bayesian MCMC data analysis, graphical models, and quantitative genetics and genomics. Dr. Rosa develops and applies statistical and computational tools for the analysis of livestock data, including beef and dairy cattle, swine, poultry among others. Examples of applications include the analysis of farm-level operational data for optimization of management practices, high-throughput phenotyping techniques for real-time monitoring of individual animals and disease surveillance, as well as quantitative genetics/genomics and breeding. He has over 200 peer-reviewed publications and nine book chapters, and has served as associate editor and reviewer for many journals, such as Animal Genetics, Bioinformatics, Biometrical Journal, Biometrics, BMC Bioinformatics, Computational Statistics & Data Analysis, Genetics, Genetics Research, Genetics Selection Evolution, Heredity, Human Heredity, Journal of Animal Science, Journal of Agricultural Biological and Environmental Statistics, Journal of Dairy Science, Journal of Poultry Science, Journal of the Royal Statistical Society - Series A, Shankia, Physiological Genomics, and Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, among others. Dr. Rosa was the Specialty Chief Editor of Livestock Genomics (specialty section of Frontiers in Genetics), and he is currently the Specialty Chief Editor of Precision Livestock Farming (specialty section of Frontiers in Animal Science).
吴晓林,威斯康辛大学麦迪逊分校动物和乳业科学的客座教授,美国奶牛育种委员会产品开发经理,主要研究方向覆盖分子遗传学、数量遗传学、统计基因组学以及生物信息学等领域。曾担任湖南农业大学动物科技学院的教授(博导)、威斯康辛大学计算遗传科学家、Bayer作物科学公司的首席科学家,以及Neogen公司生物信息和生物统计学主任。在美国多所大学,包括爱荷华州立大学,华盛顿州立大学,爱达荷大学以博士后和访问学者等身份从事科学研究。在Neogen工作期间,主持设计和研发了目前国际上被广泛使用的 GeneSeek Genomic Profiling(GGP)牛和猪系列的SNP芯片,并提出针对于低密度SNP芯片设计的多目标局域优化的策略。已发表论文180余篇和五部专著。目前的工作主要是重新评估美国奶牛的遗传评估方法和产品,特别是对于产奶性能的表型矫正方法和测定误差模型的研究。
(审核:祖智波 何俊 周军铁)
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