本研究所依托的学科1986年开始招收硕士研究生，1990年获得硕士学位授予权，1992年被湖南省教委列为省级重点学科，1995年被湖南省教委列为“211工程”预备学科，1998年获得博士学位授予权，2001年被湖南省教育厅确定为省级重点建设学科，是湖南省“十五”重点学科和湖南省“十一五”重点学科。
    现共有专职教师及研究人员19人，其中正高级人员9人，副高级人员6人；博士生导师6人，硕士生导师12人；具有博士学位的6人，硕士学位的9人。拥有教学和科研设备设施资产总值达1000多万元，先进精密仪器设备15台套。获得国家农业科技进步一等奖1项，省部级科技进步二等奖6项、三等奖7项，校级科技进步一等奖8项。
   由施启顺教授和柳小春教授育成的“湘益猪配套系”和“湘虹猪配套系”被评为湖南省2006年十大科技新闻，在我国养猪业发展中具有里程碑的意义。
    目前承担国家科技部、国家自然科学基金、国家“863”、湖南省重大科研项目等科研课题28项，具有科研经费800余万。获得省级教学成果二等奖2项、校级教学成果二等奖1项。出版专著和教材23部，发表论文700余篇，其中SCI收录的7篇。招收和培养博士、硕士研究生100多人。已基本建成人员业务能力强、学术梯队结构合理、教学和科研设备设施较为齐全、研究方向稳定发展、能持续不断进行高水平教学和研究工作的学科体系。
    主要研究动物（特别是畜禽）的遗传、繁育规律及其机理，运用生物技术和数量遗传方法改良畜禽个体与群体遗传结构，提高畜禽数量与质量的理论与实践，立足湖南，面向全国，为畜牧业的发展提供技术支持和培养高级专业人才。
主要有如下3个研究方向：
    （1）分子遗传与抗病育种：在DNA分子水平上开展地方畜禽品种的遗传标记、数量性状位点（QTL）的定位、主基因研究、探明分子遗传标记与经济性状的关系、探讨畜禽遗传病的遗传机制。
    （2）猪的遗传育种：该领域主要进行不同猪种类型的品质育种、配套系生产和杂交优势利用、分子标记辅助选择、分子标记辅助渗入、标记辅助保种等方面的研究。
    （3）家畜繁殖调控：主要研究家畜繁殖现象和规律、发情与分娩调控、精液超低温保存、超数排卵与胚胎移植（MOET）、性别控制。